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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2025 VOL.61  >>   Issue(08)   >>  69-76

综述

从组装到应用:猪高质量染色体级基因组的挑战与突破

郑卓也;牛欣然;邢凯;王楚端;

作者单位:

中国农业大学动物科学技术学院

作者简介:

郑卓也(2002-),男,浙江台州人,硕士研究生,主要进行猪基因组方面研究,E-mail:zhuoyezheng@cau.edu.cn;

通讯作者:

邢凯(1986-),男,山东冠县人,博士,副教授,主要从事动物遗传育种研究,E-mail:xk@cau.edu.cn;

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摘要
闭合
猪(Sus scrofa)作为重要的家畜,不仅是人类动物蛋白的主要来源,也因与人类生理结构相似,成为常用的医学模型动物。我国拥有89个地方猪种,但面临种质退化和濒危问题,亟需借助基因组技术保护遗传资源。随着测序技术的发展,构建染色体水平的高质量基因组组装成为解析猪遗传结构、推动精准育种的关键工具。本文回顾了猪参考基因组从一代到三代测序组装的发展历程,介绍多种辅助组装策略及其应用场景,并对当前染色体水平猪基因组组装成果的关键指标(如Scaffold N50、BUSCO完整性与gaps数量)进行了比较,指出尽管当前猪基因组整体质量较高,但在重复区域拼接与组装标准化方面仍有提升空间。文章还指出了猪基因组研究面临的挑战,如缺乏统一评价体系、功能研究转化率低等。展望未来,T2T组装、泛基因组、单细胞技术和多组学融合构建将推动猪基因组研究迈向更高精度与更广阔应用。
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033