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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2025 VOL.61  >>   Issue(07)   >>  199-207

遗传育种

中山麻鸭SOCS1基因克隆、组织表达及生物信息学分析

刘春红;廉春杨;吕志航;张玉倩;李德洪;张雪莲;

作者单位:

佛山大学动物科技学院

作者简介:

刘春红(1998-),女,广东梅州人,硕士,主要从事水禽疫病防控研究,E-mail:lch969525@163.com;

通讯作者:

张雪莲(1988-),女,黑龙江延寿人,博士,讲师,主要从事水禽疫病防控研究,E-mail:zxlsjw0312@163.com;0

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摘要
闭合
为获得中山麻鸭细胞因子信号转导抑制因子1(Suppressor of Cytokine Signaling 1, SOCS1)基因CDS序列,明确其生物学功能,了解其在不同阶段不同组织中的表达模式,本研究以中山麻鸭雏鸭、青年鸭和成年鸭为研究对象,通过TA克隆获得CDS序列,并对序列进行生物信息学分析,采用RT-qPCR方法检测SOCS1基因在不同年龄段不同器官的表达差异。结果发现,中山麻鸭SOCS1基因CDS区长624 bp,含有22个稀有密码子,编码207个氨基酸;中山麻鸭SOCS1基因与北京鸭、凤头潜鸭和天鹅的核苷酸序列相似性分别为100%、99.4%、97.6%;进化树结果表明,中山麻鸭SOCS1基因与北京鸭的亲缘关系最近,说明SOCS1基因编码序列具有种属特异性;其编码的蛋白分子量为23.104ku,理论等电点9.71,不含N-糖基化位点,存在24个磷酸化位点,属亲水性碱性蛋白;SOCS1蛋白二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主,三级结构与二级结构基本一致,且SOCS1蛋白含有一个中央SH2结构域和一个SOCS盒结构域,不存在信号肽和跨膜结构,为非分泌型蛋白,主要存在于细胞核中;...
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033