鸡、鸭、鹅、鸽子产蛋量间有明显差异，但至今尚未有研究系统地比较不同品种家禽间产蛋量差异背后的基因表达差异。试验收集了4个不同禽类物种（涵盖芦花鸡5只、凌云黑骨鸡6只、金定鸭6只、番鸭12只、朗德鹅6只、四川白鹅6只和家鸽6只）按高低产蛋量分组的卵巢转录组样本，通过差异表达、物种特异性等一系列生物信息学分析挖掘影响家禽间产蛋性能的关键候选基因及重要信号通路。试验发现4种家禽高低产蛋组的差异表达基因均富集于神经活性配体-受体相互作用信号通路等通路，物种特异性基因主要涉及神经活性配体-受体相互作用信号通路和钙信号通路等通路。对比高低产蛋组间差异表达基因和物种特异性基因，在鸡、鸭、鹅和鸽子中分别发现5、3、9、21个交集基因，尤其涉及神经活性配体-受体相互作用信号通路的GAL、NPY和GPR83基因，这些基因可能是造成鸡、鸭、鹅和鸽间产蛋量差异的关键基因。本研究初步解析了常见家禽间产蛋差异的遗传机制，为后续家禽产蛋相关基因的功能研究提供了重要信息。