为获得关中奶山羊半胱天冬酶-3（Caspase-3）基因CDS区，探究其生物信息学功能及其在关中奶山羊不同组织的表达规律，本研究以关中奶山羊乳腺组织cDNA为模板，通过PCR技术克隆Caspase-3基因的CDS区，并对其进行测序。在此基础上，对其进行生物信息学分析，实时荧光定量PCR检测Caspase-3基因在关中奶山羊乳腺、心脏、肾脏、子宫、脾脏、肝脏组织中的表达情况。结果显示：关中奶山羊的Caspase-3基因CDS区全长828 bp，编码275个氨基酸。氨基酸相似性比对结果显示，关中奶山羊Caspase-3基因与绵羊、羚牛、水牛、家牛、黇鹿、猪、双峰驼、人、小鼠的相似性分别为99.6%、98.5%、95.3%、94.5%、90.5%、88.4%、86.5%、83.6%、81.8%。系统进化树显示，关中奶山羊Caspase-3基因与绵羊、羚牛的亲缘关系更近，与双峰驼、猪、人、小鼠亲缘关系较远。关中奶山羊Caspase-3蛋白分子式为C1361H2144N362O426S21