染色质转座酶可及性测序（ATAC-seq）技术是在全基因组水平上揭示染色质可及性的有效方法，近年来在分析畜禽的染色质可及性后确定不同品种间基因表达调控机制的异同中展现了巨大潜力，为复杂的生物系统提供了许多有价值的见解。本文对ATAC-seq技术在畜禽分子育种中的应用如肌肉发育、脂肪沉积、育种及繁殖、疾病等方面进行综述，以期为染色质可及性以及基因表达调控的相关研究提供参考资料。