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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2025 VOL.61  >>   Issue(02)   >>  143-149

遗传育种

泰山黑猪基因组选择信号分析

郭宝港;王明凯;张文娟;申小冉;于世浩;曾勇庆;陈伟;

作者单位:

1.山东农业大学动物科技学院,山东省家畜种质创新与利用重点实验室2.泰安巴夫巴夫农业科技有限公司3.宁阳县农业高新技术产业发展服务中心

作者简介:

郭宝港(1997-),男,山东泰安人,硕士研究生,主要从事猪遗传育种学研究,E-mail:908318556@qq.com;

通讯作者:

曾勇庆(1964-),男,安徽来安人,教授,博士生导师,主要从事猪遗传育种学研究,E-mail:yqzeng@sdau.edu.cn;

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摘要
闭合
本文旨在检测泰山黑猪基因组选择信号,挖掘泰山黑猪的优良种质特性基因,为泰山黑猪的选育提供理论依据。以泰山黑猪为研究对象,利用中芯一号SNP芯片对泰山黑猪进行基因分型,结合莱芜猪、里岔黑猪的芯片数据,利用群体遗传分化指数(Fst)和核苷酸多态性比值(θπ)进行基因组选择信号分析,滑动窗口长度为50 kb、步长20 kb,取Fst和θπ前5%窗口的交集为基因组受选择区域,并对候选基因进行GO和KEGG富集分析。分别以莱芜猪和里岔黑猪作为参考群体,对泰山黑猪进行选择信号分析,分别检测出685个和340个受选择区域,分别注释到417和215个基因;并筛选到与泰山黑猪繁殖性能(CCDC87、HIPK4、THRB、CAPN11、EPHB2、SRD5A1、TLE6)、生长发育(AKIRIN2、HSD17B4、MIR27B、TGIF1、RPS20、PLAG1)、脂肪沉积(NDUFS4、COL21A1、DNAJC1、DNMT3A、FN1、GNPDA2)、猪肉品质(ITGA11、PNKD)等重要经济性状相关的候选基因。在富集分析中发现,显著通路多与代谢、MAPK通路、脂肪沉积等有关;通路中HSD17B4、...
参考文献
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033