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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2025 VOL.61  >>   Issue(01)   >>  212-222,226

遗传育种

鸡EGFR基因的功能分析及其对颗粒细胞中基因表达的影响研究

陈 林,王家乡,吴 艳,皮劲松,蒲跃进

作者单位:

1.湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北武汉 430064

2.长江大学动物科学学院,湖北荆州 434025

3.湖北省畜牧技术推广总站,湖北武汉 430064

作者简介:

陈林(1997-),男,河南商丘人,硕士研究生,主要从事家禽遗传育种研究,E-mail:1843845190@qq.com

通讯作者:

吴艳(1979-),女,陕西西安人,博士,研究员,主要从事家禽遗传育种与分子生物学研究,E-mail:wuyanwh@163.com;蒲跃进(1977-),男,陕西咸阳人,博士,副研究员,主要从事家禽繁育及健康养殖技术集成研究,E-mail:276152134@qq.com

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摘要
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本文旨在研究鸡卵泡颗粒细胞EGFR基因的功能并对其过表达后进行转录组和生物信息学分析,为进一步研究EGFR基因在鸡卵泡颗粒细胞发育中的调控机制提供理论基础。利用qRT-PCR技术探索EGFR基因过表达后细胞凋亡关键基因(BCL2、c-myc、casp3)以及氧化应激相关基因(SOD2、CYP19、GPX2)的表达量,进而确定其在颗粒细胞中的功能;利用RNA-seq测序技术对EGFR基因过表达后的卵泡颗粒细胞进行转录组学分析,筛选差异表达基因,并对其进行GO和KEGG注释及qRT-PCR验证。在对照组(空载体)和试验组(EGFR基因过表达)颗粒细胞样本中分别获得2.361×107和2.399×107条Clean Reads,其中对照组和试验组共有90.61%的Clean Reads比对到鸡参考基因组上。DESeq分析发现共有1 356个基因在2组间差异表达,其中790个基因上调,566个基因下调,包括与细胞功能相关基因,如SLC2A12、HSPB9、ANO1、CCL4、HMOX1、Nurr1等。GO分析发现,差异表达基因主要富集在转录正调控、DNA模板化、含有核酸酶的化合物代谢的阳性调节以及RNA代谢的正调控等过程。KEGG通路主要富集在类固醇生物合成、溶酶体和局部粘连及细胞外基质受体相互作用等过程。GO和KEGG富集结果表明,EGFR基因过表达后,SLC2A12、HSPB9、ANO1基因表达量显著或极显著上调,CCL4、HMOX1、NR4A2基因表达量显著或极显著下调,推测EGFR基因可以通过调控颗粒细胞中相关基因及信号通路的表达,进而调控卵泡的发育。本研究为分析EGFR基因对卵泡发育的调控机制提供了理论参考依据。
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033