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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2025 VOL.61  >>   Issue(01)   >>  203-211

遗传育种

基于布莱凯特黑牛胎盘转录组数据筛选胎盘发育候选基因

苗秀萍,刘瑞莉,张文琦,陈振鹏,王秀源,梅艳芳,肖超柱,张任政,柏学进,董雅娟

作者单位:

1.青岛农业大学动物科技学院,山东青岛 266109

2.黑牛种业技术创新中心,山东青岛 266109

3.山东兆福牧业科技股份有限公司,山东淄博 256306

作者简介:

苗秀萍(2000-),女,河南洛阳人,硕士研究生,主要从事动物遗传育种与繁殖,E-mail:Mxp2011343721@163.com

通讯作者:

董雅娟(1964-),女,山东文登人,教授,硕士生导师,主要从事动物遗传育种与繁殖,E-mail:etcenter@126.com

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摘要
闭合
本研究以布莱凯特黑牛胎盘组织为试验材料,通过转录组测序和生物信息学分析筛选胎盘发育的候选基因,为胎盘发育提供一定的理论基础。根据胎盘的长度、宽度、厚度和重量,将布莱凯特黑牛分为大胎盘组(BigPlacenta,BP)和小胎盘组(Small Placenta,SP),每组各4头,转录组测序构建胎盘文库,根据P-value≤0.05且|Fold Change|≥1.5为标准筛选差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs),对DEGs进行GO、KEGG和构建蛋白互作网络(Protein-Protein Interaction,PPI)分析,结合胎盘表型及与DEGs的表达筛选候选基因;通过qRT-PCR和Western Blot对候选基因进行表达鉴定。结果表明:BP和SP组共有580个DEGs,其中238个DEGs在大胎盘中上调,342个下调,GO和KEGG富集分析显示DEGs显著富集在与胎盘发育相关的生物过程(胚胎胎盘发育、胚胎造血等)和通路(氧化磷酸化、NF-κB等)中。结合PPI筛选出与细胞增殖相关的10个基因(IL6、TNF、TFRC、ADGRL3、ACTA1、CD24、GNG11、COX2、COX1、COX3);相关分析表明:COX1、COX2、COX3与胎盘重呈极显著负相关,且拟合程度高,筛选为候选基因。转录和蛋白表达鉴定显示:COX1、COX2和COX3在胎盘中的表达水平显著高于其他组织。综上,COX1、COX2、COX3可作为胎盘发育的候选基因,通过氧化磷酸化通路抑制胎盘生长发育。本研究为深入探究胎盘发育过程中的分子机制提供了理论支持。
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033