可变剪接（Alternative Splicing，AS）是一种调控机体转录本、蛋白质多样性的分子机制，参与机体的病理、生理反应过程，因其剪接位点的不同产生异常的转录本，由此产生病理状态。为了研究不同体细胞数（Somatic Cell Count，SCC）的新疆褐牛基因水平的表达差异，利用RNA-seq对High SCC、Low SCC的新疆褐牛血液中的差异表达基因/差异可变剪接基因进行筛选，并进行生物信息学分析。结果显示：High vsLow组中，共筛选到332个差异表达基因（245个上调，87个下调），这些基因主要与炎症反应、免疫反应、NF-κB信号通路、趋化因子信号通路等相关；针对可变剪接事件分析发现，389个差异可变剪接基因参与抗原处理和呈递、细胞粘附分子、趋化因子信号通路等重要通路，结合PPI结果进一步筛选到可能参与乳房感染的关键基因（CXCL2、TNF、IL-1β、IL-10、CD4等）。本研究结果为乳房炎抗性相关分子标记的开发提供了数据支撑。