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中国畜牧杂志

中国畜牧杂志  >>  2025 VOL.61  >>   Issue(01)   >>  150-157

遗传育种

鸡Sox10基因克隆、生物信息学及组织表达分析

徐硕辉,张朋威,朱慧媛,宋素芳,李文婷,孙桂荣,田亚东,康相涛,李东华

作者单位:

1. 河南农业大学动物科技学院,河南郑州 450000

2. 河南牧业经济学院,河南郑州 450000

3. 农业农村部畜禽资源(家禽)评价利用重点实验室,河南郑州 450000

作者简介:

徐硕辉,男,硕士,研究方向:动物遗传与育种科学研究,E-mail:xushuohui0311@qq.com

通讯作者:

李东华,女,博士,讲师,研究方向:家禽遗传育种与营养调控,E-mail:lidonghua6656@126.com

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摘要
闭合
为了探究Sox10(SRY-related HMG-box 10)氨基酸序列特征以及Sox10在淅川乌骨鸡不同组织的表达量变化,试验对淅川乌骨鸡Sox10基因CDS区进行PCR克隆并使用在线软件分析氨基酸序列,同时,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分别检测Sox10在心、肝、胸肌、腿肌和背肤的表达水平。结果表明:Sox10基因CDS区测序长度为1 386 bp,编码了461个氨基酸。同源性比对和系统进化树显示,淅川乌骨鸡与原鸡的亲缘关系最近,与鱼类最远。Sox10蛋白分子质量为49.86 ku,等电点为6.20,具有不稳定性、酸性和亲水性,且不存在跨膜区和信号肽,存在HMG结构域及55个磷酸化位点,5'端2 000 bp不含甲基化位点。Sox10主要包括无规则卷曲,大部分位于细胞核,与DCT、EDNRB、Pax3、Pax7等蛋白存在互作关系,参与细胞发育过程中的DNA、蛋白质结合以及转录调节功能。qRT-PCR结果表明,Sox10在背肤的表达量显著高于心、肝、胸肌和腿肌,在肝脏和胸肌的表达量显著低于心、腿肌和背肤。以上结果为进一步探究Sox10基因对黑色素沉积的调控机制提供了理论依据。
参考文献
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相关文献
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期刊名称:中国畜牧杂志

创办日期:1953年

主管部门:中国科学技术协会

主办单位:中国畜牧兽医学会

刊期:月刊

电话:010-62732723;010-82893431;010-62734608

Email信箱:zgxmzz@cau.edu.cn

国内统一刊号:CN 11-2083/S

国际标准刊号:ISSN 0258-7033