我国拥有十分丰富的地方猪种遗传资源，近年来各地纷纷引入不同生产性能的外来猪种以满足商品市场的发展需求，导致中国地方猪种资源受到严重威胁，遗传多样性日益减少，如何有效保护地方猪种资源是亟待解决的问题。本研究采集254头中国地方品种（藏猪、二花脸猪、金华猪、民猪、荣昌猪、五指山猪）以及杜洛克商品猪种，基于Illumina公司的猪60K SNP芯片数据进行各品种遗传多样性分析，并根据获得的遗传多样性数据进行猪品种保护的优先权分析。通过方法间比较，本研究认为分子共祖先法和等位基因丰富度法是计算群体遗传多样性最为有效的方法，可作为评估猪种质资源保护优先权的推荐分析方法。基于该方法获得的分析结果表明，在所研究的地方猪品种中，我国需要进行优先保护的前3个地方品种为民猪、藏猪、金华猪。本研究结果可为地方猪种资源保护工作提供参考。