- 余健;杨文静;王晔;周磊;王楚端;刘剑锋;
本研究收集了来自中国不同地区的3个核心育种场2013—2017年共4 278头大白猪的性能测定记录,计算了3个场之间的关联率,构建了基因组选择混合参考群。同时基于芯片和系谱数据,采用线性混合模型,分别估计了单个场的基因组选择准确性和联合遗传评估准确性。结果表明:3个场之间有紧密的遗传联系,其关联率分别为:0.509、0.357、0.337。基于系谱的联合遗传评估,准确性能够提高8%～10%;基于基因组的联合遗传评估,准确性可以提高12%～15%。本研究探究了基因组联合育种在生产中的可行性,为我国进一步实施猪联合育种提供了依据。
2021年S1期 v.57 25-28页 [查看摘要][在线阅读][下载 1723K] [下载次数：72 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：72 ] - 乔木;吴俊静;彭先文;梅书棋;
本实验旨在探究猪NNAT(Neuronatin)基因印记状态、遗传多态性及其与胴体和肉质性状的关系,为印记基因成为猪肉质性状遗传改良的分子标记提供理论依据。通过PCR产物直接测序发现在NNAT基因3'UTR区存在一处C/T突变,鉴定了NNAT基因在梅山猪与大白猪正反交产生的65d胚胎的背部脂肪组织中的印记状态;在起始密码子上游-107 bp处存在一处G/A突变,利用PCR-Alu I-RFLP技术在大白猪、长白猪和梅山猪中进行了基因分型,并在279头大白猪与梅山猪杂交产生的F2代群体中进行性状关联分析。结果表明,猪NNAT基因在所检测组织中为父本表达、母本印记;-107 bp处的G/A突变与眼肌高、眼肌宽、眼肌面积、背最长肌含水量、背最长肌大理石纹、股二头肌大理石纹显著相关。
2021年S1期 v.57 29-32页 [查看摘要][在线阅读][下载 1973K] [下载次数：57 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：29 ] - 邱奥;王雪;孟庆利;张勤;丁向东;
高密度SNP芯片目前已广泛应用于畜禽性状遗传解析和育种实践中,芯片类型和密度也各有不同,不便统一使用,影响群体规模扩大,进而影响遗传解析和分子育种的效力。基因型填充提供了将不同芯片统一使用的可能,本研究比较了3款由不同研究机构和公司设计的猪50K SNP芯片(Geneseek、中芯一号、液相50K)基因型填充效果,以探索猪不同芯片统一使用的可行性。本研究采集2 043头法系大白猪,分别使用上述3款芯片对个体进行基因型分型,不同2款芯片分别有100(Geneseek与中芯一号)、57(Geneseek与液相50K)、100(中芯一号与液相50K)头相同个体进行检测。采用直接填充和合并填充2种策略比较3款芯片基因型填充效果,通过共同个体基因型一致性和相关系数评价基因型填充准确性。结果表明,直接填充中,相同参考群体规模下,液相50K作为基因型填充参考群体最理想,Geneseek和中芯一号填充至液相50K准确性最高,Geneseek和液相50K 2款芯片由于相同位点最多,互相填充的基因型准确性更高,平均基因型准确率为0.92。合并填充能够扩大不同芯片的标记数量,增加了填充参考群体规模,但填充准确性Geneseek和液相50K组合时略低于直接填充。当Geneseek和中芯一号、液相50K和中芯一号组合时,合并填充表现则略有不同,合并填充有助于Geneseek和液相50K填充准确性提升,但降低了中芯一号填充的准确性。相同位点多的Geneseek和液相50K芯片合并填充效果最好。研究结果同时表明,扩大填充参考群体规模是提高基因型填充准确性的有效途径。本研究表明3款猪50K芯片之间的基因型填充是可行的,为我国猪分子育种提供了参考。
2021年S1期 v.57 33-38页 [查看摘要][在线阅读][下载 1769K] [下载次数：111 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：28 ] - 张丰霞;翟丽维;刘怡冰;敖红;李千军;杨婷;杨金艳;刘华涛;邢凯;石咏;马福平;李航;俞英;王楚端;
本研究旨在研究猪NQO1基因沉默对细胞内猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus, PRRSV)复制的影响,并初步探究其作用机制。选用对PRRSV易感的PK15-CD163细胞系,对NQO1进行RNA干扰使NQO1沉默,并在RNA干扰24 h进行PRRSV减毒活疫苗株攻毒,每组4个重复,攻毒24 h后首先通过qRT-PCR检测基因NQO1沉默对PK15-CD163细胞内PRRSV复制的影响,其次进行转录组测序,分析NQO1沉默引起的差异表达基因(Differentially Expressed Genes, DEGs),并对DEGs进行功能富集分析,探究NQO1沉默影响PRRSV复制的作用机制。结果表明:NQO1沉默能够抑制PK15-CD163细胞内PRRSV的复制,NQO1为潜在的PRRSV易感基因,并且NQO1沉默可能通过上调IL6和IL15的表达增强JAK-STAT信号转导,从而增强细胞的抗病毒能力,抑制PRRSV的复制。
2021年S1期 v.57 39-45页 [查看摘要][在线阅读][下载 1949K] [下载次数：66 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：17 ] - 张冬杰;柳樱子;汪亮;杨秀芹;刘娣;
本课题组在前期研究中发现IRS1是民猪和大白猪背最长肌中存在表达差异的一个关键基因,为了深入探讨IRS1在骨骼肌细胞中发挥的生物学功能,本研究首先将猪的IRS1基因完整编码区序列连入pcDNA3.1载体内,构建过表达质粒,同时人工合成IRS1的siRNA干扰序列,在C2C12细胞系内过表达或干扰IRS1基因,使用qRT-PCR技术检测生肌决定因子家族基因(MyoD、MyoG和Myf5)、决定肌纤维类型的MyHC I、MyHC IIa、MyHC IIb和MyHC IIx基因以及PI3K、Akt、FoxO1基因的表达变化情况。结果表明,干扰IRS1基因后,肌细胞分化受阻,MRFs表达有下降趋势,过表达IRS1后,MRFs在不同分化时间发生了显著上调,说明IRS1对MyoD、Myf5和MyoG的转录有促进作用。过表达IRS1基因后,决定肌纤维类型的MyHC IIa基因和MyHC IIx基因表达水平均在诱导分化第6天时发生显著上调,干扰IRS1基因后,MyHCI型肌纤维在第4天和第6天、MyHCIIx型在第6天时的表达量均发生了显著下调,说明IRS1可影响肌纤维类型。干扰IRS1基因后,诱导分化初期(2 d)Akt的表达量出现显著下调,到了诱导分化末期(6 d),FoxO1表达量出现显著上调,说明IRS1表达的变化可以激活IRS1/Akt/FoxO1信号通路。
2021年S1期 v.57 46-51+56页 [查看摘要][在线阅读][下载 1875K] [下载次数：132 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：25 ] - 甘建宇;臧旭鹏;程昕琰;洪林君;吴珍芳;
为探究细胞铁死亡相关基因异常表达对母猪妊娠早期胚胎丢失的影响,本实验选取妊娠28 d母猪为研究对象,采集胚胎发育正常和发育停滞状态下的子宫内膜组织,提取总RNA,利用qRT-PCR技术分析胚胎附植及细胞铁死亡相关基因的表达水平,并分析基因之间的表达相关性。通过免疫组化技术进一步测定GPX4、VEGFD蛋白在不同子宫内膜组织中的定位表达。qRT-PCR结果显示,GPX4(P<0.01)、ACSL4(P<0.01)、CP(P<0.01)、GCLM(P<0.01)、ADM(P<0.05)、GCM1(P<0.01)和WNT7A(P<0.05)在胚胎发育正常组子宫内膜的表达要显著或极显著高于胚胎发育停滞组,SLC7A11(P<0.05)、BVES(P<0.01)和VEGFD(P<0.01)在胚胎发育正常组子宫内膜的表达要显著低于胚胎发育停滞组。相关性分析表明,呈明显正相关和明显负相关的基因各有8对。免疫组化分析发现,GPX4蛋白主要表达于胚胎发育正常组子宫内膜的上皮细胞,VEGFD蛋白则主要表达于胚胎发育停滞组子宫内膜的上皮细胞。本研究结果表明,猪子宫内膜细胞铁死亡相关基因的异常表达可能会影响胚胎发育并导致胚胎丢失,为进一步探究猪妊娠早期胚胎丢失的分子机制提供了参考。
2021年S1期 v.57 52-56页 [查看摘要][在线阅读][下载 2123K] [下载次数：89 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：24 ] - 张蕾;孙敬春;肖锦红;李栋;赵昕;杨公社;于太永;
本研究旨在探究不同分娩胎次、年份、季节对大白母猪繁殖性能的影响,为提高大白猪群的繁殖效率提供参考依据。研究数据源于陕西某核心育种场2009—2020年的大白猪16 275条繁殖性能的测定记录,利用R软件对影响繁殖性能的胎次、年份、季节因素进行方差分析。结果表明:大白猪第1胎的总产仔数(9.72头)、产活仔数(8.78头)、健仔数(8.38头)最少,出生窝重(12.72 kg)最小,3～4胎繁殖性能达到最佳状态,总产仔数10.60头,产活仔数9.81头,健仔数9.58头;5胎开始死胎数(0.75头)、死仔数(0.84头)、弱仔数(0.23头)显著增加;季节效应对大白猪繁殖性能影响显著,春季分娩时产仔数最多,冬季分娩时死胎数、死仔数、弱仔数等损失仔数最少;不同年份比较结果显示,2011年和2018年大白猪损失仔数最多,繁殖性能最差。综上,繁殖性能受胎次、年份、季节等环境因素的影响,生产中可适当淘汰6胎及以上产龄过大的母猪,适当增加育种规划中冬春季分娩的窝数;另外,年份效应对繁殖性能的影响可通过提高饲养管理水平来矫正。
2021年S1期 v.57 57-59+68页 [查看摘要][在线阅读][下载 1686K] [下载次数：108 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：34 ] - 甘麦邻;杨琼;杜建国;张顺华;沈林園;朱砺;
为探究脐带血microRNAs(miRNAs)对猪胎儿发育的影响,对82头正常和宫内发育迟缓(IUGR)猪的体重和体尺进行测量,同时对正常和IUGR猪脐静脉(UV)血和脐动脉(UA)血进行小RNA测序,使用差异百分比的形式分析差异表达miRNAs,利用RT-qPCR技术检测miRNAs在脐带血和组织中的表达。结果显示:IUGR猪除体重低于正常猪外,脐带直径、脐静脉直径和脐动脉直径均显著低于正常猪;在总miRNAs的比例中,脐静脉富集miRNAs(Top20)占83.08%,脐动脉富集miRNAs占77.53%。对脐带血富集miRNA的功能注释分析发现,虽然脐静脉和脐动脉富集的miRNAs不同,但miRNAs富集的信号通路高度相似(正常:64.81%,IUGR:81.79%)。miRNA表达特征分析和功能富集分析显示miR-148a-3p和miR-26a分别是脐静脉和脐动脉的代表性miRNA。miR-451则是正常和IUGR猪典型的差异miRNA,其不仅在正常猪的脐静脉和脐动脉中表达最高,而且在IUGR猪的脐静脉和脐动脉之间差异最大,细胞实验表明miR-451的过度表达可显著抑制细胞增殖。本研究全面分析了猪脐带血富集miRNAs的组织表达特征,这些特征和代表性、特征性miRNAs的发现将有助于进一步理解IUGR发生的表观遗传调控机制,同时为猪脐带血的开发和利用提供了参考。
2021年S1期 v.57 60-68页 [查看摘要][在线阅读][下载 3287K] [下载次数：38 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：30 ] - 石丽丹;王小女;张孟浩;聚明明;李新建;韩雪蕾;王克君;李秀领;周李生;乔瑞敏;
乳头数是评价母猪繁殖性能的重要参数,是大白猪选种的重要指标之一。本研究利用1 118头大白猪母猪群体,利用50K SNP芯片对该群体进行基因分型,采用单变量混合线性模型的全基因组关联分析(GWAS)及Fst选择信号分析,筛选该群体的左乳头数、右乳头数和总乳头数性状相关基因。结果显示:GCTA软件计算左、右、总乳头数性状的遗传力分别为0.062、0.006、0.047。GEMMA软件共检测到10个达到染色体显著水平(P<2.17E-05)的SNP位点,分别位于2个区间:1个位点(ASGA0092517)位于SSC16的关联区间为61.3～61.4 Mb,与左乳头数相关,AA基因型为优势基因型;9个位点位于SSC2的关联区间为123.1～124.0 Mb,与右乳头数和总乳头数相关,2个性状显著位点P值最小的位点为同一位点(ASGA0011685),TT基因型为优势基因型。GCTA软件选择信号分析结果显示,GWAS检测到的SSC2上的9个SNPs均超过显著性阈值(Fst值>0.12);SSC7上检测的41个显著SNPs中有40个位于已报道的乳头数相关QTLs中。2、7、16号染色体显著SNPs位点上下游1 Mb区域内共包含63个基因。其中,GABRG2、GABRA1、PRDM6、HSD17B4、HSD17B11、GABRB2、FAM170A、RAD51B为乳头数强相关基因。研究检测到显著区间可作为分子标记用于大白母猪乳头数的选育。
2021年S1期 v.57 69-75+83页 [查看摘要][在线阅读][下载 2680K] [下载次数：163 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：21 ] - 蒋能静;侯黎明;刘晨曦;周天威;张萍;黄媛;陆志强;华金弟;周腾彬;阮丽莎;石晓峰;李平华;黄瑞华;
实验旨在基于前期从二花脸猪群体鉴别到的猪8号染色体上影响产仔数性状的数量性状基因座(Quantitative trait loci,QTL),通过增加群体的数量(二花脸猪和梅山猪)以及分子标记的密度(1个SNP/14.5kb),利用单标记关联分析和合并群体的荟萃分析精细定位猪8号染色体影响产仔数的QTL,并挖掘QTL区域内候选基因。结果表明,基于二花脸猪群体的单标记关联分析,将影响经产胎次(2～7胎)产活仔数(Number born alive,NBA)的QTL分别精细定位至33 818 121～34 324 224 bp;基于梅山猪群体的单标记关联分析,将影响经产胎次(2～7胎)NBA的QTL分别精细定位至33 884 473～34 156 584 bp;基于二花脸猪群体和梅山猪群体荟萃分析,将影响经产胎次(2～7胎)NBA的QTL精细定位到33 934 355～34094188bp;最后将关联分析和荟萃分析重叠,将影响猪经产胎次(2～7胎)NBA的QTL精细定位到33934355～34094188bp;并且在QTL区间内发现UCHL1为关键位置功能候选基因。综上,本研究通过增加群体和标记密度成功在猪8号染色体上精细定位影响产仔数的QTL,并在QTL精细定位区间内发现UCHL1基因为影响猪产仔数的候选基因。
2021年S1期 v.57 76-83页 [查看摘要][在线阅读][下载 1955K] [下载次数：48 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：22 ] - 贺婕妤;王斌虎;廖柱;谢红涛;易国强;刘毓文;敖红;唐中林;
本研究旨在分析长白和大白母猪不同胎次的繁殖性能,并利用不同的分析模型对其繁殖性状进行遗传参数估计。利用R语言对812头长白猪和2 153头大白猪的繁殖性状进行统计,ASReml软件的GLM模型分析年份、季节、胎次、妊娠周期对长白和大白猪繁殖性状的影响,同时利用简单模型和重复力模型计算各性状的遗传方差组分、遗传力、表型相关和遗传相关。结果表明:妊娠年份、季节、胎次以及妊娠期均对母猪的繁殖性状有显著影响,其中第3～5胎时繁殖性能最好;利用简单模型计算母猪的繁殖性状遗传力在0.08～0.17之间,重复力模型计算的遗传力在0.03～0.12之间;在长白和大白猪中各性状均呈正相关,长白猪总产仔数(Total NumberBorn,TNB)与产活仔数(NumberBorn Alive,NBA)的遗传相关为0.925,表型相关为0.798,健仔数(Number Born Healthy,NBH)与NBA、初生窝重(Litter Birth Weight,LBW)的遗传相关分别为0.837、0.880,表型相关分别为0.894、0.896。
2021年S1期 v.57 84-88页 [查看摘要][在线阅读][下载 1968K] [下载次数：104 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：24 ] - 张蕾;王鹏飞;孙敬春;钟亮;肖子通;李琦;杨公社;于太永;
本研究旨在对长白猪繁殖性状进行遗传参数估计,为制定符合本场的育种方案、加快遗传进展提供科学依据。研究数据源于陕西某核心育种场2009—2020年长白猪的5 600条繁殖性能的测定记录,利用R软件对繁殖性状的固定效应进行方差分析,通过DMU软件估计各性状的遗传力、表型相关与遗传相关。结果表明:分娩胎次、年份、季节对长白猪的繁殖性能均有影响;除妊娠周期遗传力为0.18,属于中等遗传力性状,其他繁殖性状遗传力在0.01～0.08之间;遗传相关显示总产仔数、产活仔数、健仔数、初生窝重之间均为高度正相关,本场的妊娠周期均值在117 d左右,且与产活仔数、总产仔数等繁殖性状间均呈现中度负相关,说明妊娠周期过长会对繁殖性能产生不利影响。
2021年S1期 v.57 89-91页 [查看摘要][在线阅读][下载 1674K] [下载次数：107 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：23 ] - 李若岚;代宇星;温作晨;徐高骁;鲍恒;黄越;郭亮;蒲蕾;
实验旨在明确促卵泡素受体(FSHR)和黄体生成素β亚基(LHβ)基因多态性与法系长白猪繁殖性状的相关性以及基因多位点联合选育效果。选用384头法系长白猪,对其进行DNA提取、PCR扩增、基因测序,对突变位点的多态性信息与繁殖性状的关联性及多基因联合效果进行分析。结果表明:FSHR c.532 G>A位点GG和GA型个体的总产仔数表型值高于AA型个体(P<0.05),FSHRc.1166C>T位点TT型个体的总产仔数估计育种值高于CC型和CT型个体(P<0.05),LHβc.314 G>T位点GT型个体总产仔数表型值和估计育种值均高于TT型(P<0.05)和GG型(P>0.05)个体;三位点合并分析发现,GGTTGG、GATTGG型个体的总产仔数表型值高于其他组合个体(P>0.05),EBV值高于AACCGG型、AACTGG型个体(P<0.05)和其他组合个体(P>0.05);单位点分析发现,FSHR和LHβ基因多态性与法系长白猪的繁殖性状呈显著相关;多位点联合分析发现,FSHR和LHβ基因的优势组合为GATTGG、GGTTGG型,且联合选择效果优于单位点选择效果。
2021年S1期 v.57 92-97页 [查看摘要][在线阅读][下载 1698K] [下载次数：59 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：39 ] - 刘蓥珂;李晨雷;齐昆龙;王克君;乔瑞敏;李新建;李秀领;韩雪蕾;
实验以河南某育种场的美系大白母猪的10 229条繁殖记录为基础,分析不同配种季节、初配日龄、胎次和近交系数等因素对繁殖性能的影响。结果显示:冬季配种的初生窝重、断奶仔数和校正21日龄窝重均显著高于其他季节,且健仔数显著高于春季和夏季;初配日龄为211～240 d的健仔数和初生窝重显著高于210 d及以下,断奶仔数显著高于271～300 d,弱仔数和畸形数最低,且显著低于300 d以上;产仔性能随着胎次的增加呈先上升后稳定再下降的趋势;3～7胎次的总产仔数、产活仔数、初生窝重和校正21日龄窝重均显著高于第1胎次;当近交系数在0.028 1～0.046 0时的断奶仔数和校正21日龄窝重高于其他近交系数组,且与近交系数在0.014 0及以下组差异达到显著水平。结果表明,配种季节、初配日龄、胎次和近交系数等因素对美系大白母猪的繁殖性能均有不同程度的影响;在生产中,美系大白母猪于211～240 d初配、冬季配种、3～7胎次、近交系数控制在0.028 1～0.046 0时的繁殖性能最佳。
2021年S1期 v.57 98-101+105页 [查看摘要][在线阅读][下载 1639K] [下载次数：6 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：21 ] - 陈海龙;张玉伦;孙强;薛慧;陈伟;曾勇庆;
为了研究不同因素对美系大白猪繁殖和生长性状的影响,分析相关性状的遗传力和选育进展,本研究以山东鼎泰牧业有限公司美系大白猪为对象,选取该场2014—2018年美系大白猪7 464窝母猪繁殖记录及14469头猪生长性能测定记录进行统计分析。利用SAS软件分析了胎次、分娩季节因素对9个繁殖性状以及性别对2个生长性状的影响,运用WOMBAT软件对相关性状的遗传力进行估计,同时利用GBS软件分析猪群的遗传选育进展。结果表明,胎次、分娩季节对美系大白猪的产仔数、初生重等主要繁殖性状均有显著影响,综合繁殖性能的变化趋势表现为第1～3胎逐渐提高,第4～5胎最佳,6胎以后开始下降;冬季分娩的综合繁殖性能最佳,其次是春、秋季,夏季最差。性别对美系大白猪生长性能影响显著,公猪达100 kg体重日龄和背膘厚比母猪低。遗传分析结果表明,美系大白猪繁殖性状遗传力范围在0.111～0.190,100 kg体重日龄及背膘厚遗传力分别为0.326和0.403;2014—2018年美系大白猪总产仔数、100 kg体重日龄及背膘厚的表型值分别提高了1.67头、6.54 d和1.07 mm,估计育种值(EBV)分别提高了0.03、1.23、0.11,符合母系猪侧重繁殖性能的选育目标,选育进展良好。
2021年S1期 v.57 102-105页 [查看摘要][在线阅读][下载 1683K] [下载次数：74 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：26 ] - 黄晓宇;任端阳;林清;苏展勤;吴细波;唐一波;邱小田;李加琪;张哲;
年产胎数和年断奶仔猪数是衡量母猪繁殖效率的重要指标,对其进行遗传参数估计可以为目标群体的管理提供参考。本研究对2004—2019年广西某良种猪场17 501头长白猪共59 037条繁殖记录进行分析,利用DMU采用多性状重复力模型估计长白猪繁殖性状的遗传参数,并评估这些性状的表型趋势以及常规繁殖性状的遗传趋势和生产力趋势。结果发现:年产胎数和年断奶仔猪数与常规繁殖性状一样,均为低遗传力性状。虽然年产胎数和年断奶仔猪数的表型趋势总体呈现下降趋势,但产仔数的表型趋势、遗传趋势和生产力趋势呈现上升趋势,说明该群体在遗传改良方面取得了一定的效果,同时也反映出其在生产管理上还存在较大的改进空间。
2021年S1期 v.57 106-110页 [查看摘要][在线阅读][下载 2314K] [下载次数：65 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：22 ] - 陈涛;朱晓东;孙厚伟;曾勇庆;陈伟;
本实验旨在研究不同胎次、分娩季节对枣庄黑盖猪繁殖性能的影响,并对初乳和常乳进行差异分析。实验选取枣庄黑盖猪养殖有限公司422窝繁殖数据,对其繁殖性状进行统计分析。结果表明:枣庄黑盖猪1～6胎的繁殖性能随着胎次增加而提高,各组间存在极显著差异,1、2、6胎健仔数较低,3～5胎健仔数最高(11.09头)。分娩季节对总产仔数和产活仔数的影响没有显著差异,但各季节略有不同,其中死胎数和弱仔数夏季最高且与其他3个季节差异极显著;初乳(1 d)的非脂乳固体、乳糖、乳蛋白和灰分含量均高于常乳(14 d)(P<0.01),常乳乳脂率和水分均高于初乳(P<0.01),表明初乳比常乳有机物质含量高。研究表明枣庄黑盖猪3～5胎繁殖性能最佳,枣庄黑盖猪受夏季高温影响较大。
2021年S1期 v.57 110-113页 [查看摘要][在线阅读][下载 1772K] [下载次数：76 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：21 ] - 邱丙姗;吴正明;李再磊;李志勋;陈哲;赵桂英;
为了研究LPL基因表达量对高黎贡山猪肌肉脂肪酸含量的调控作用,本实验采用实时荧光定量PCR技术测定LPL基因在高黎贡山猪3个组织中的相对表达量,用气相色谱-质谱联用法对背最长肌脂肪酸含量进行测定,并将LPL基因相对表达量与肌肉脂肪酸含量进行关联分析。结果显示,LPL基因在高黎贡山猪3个组织中的相对表达趋势为:背脂>背最长肌>肝脏;LPL基因在肝脏组织中的相对表达量与肌内十六酸、亚油酸、二十二碳六烯酸、ω-3PUFA、ω-6PUFA含量呈显著负相关;在背最长肌组织中的相对表达量与ω-6/ω-3PUFA呈显著正相关;在背脂组织的相对表达量与肌肉脂肪酸含量无显著相关性。说明LPL基因对高黎贡山猪肌肉脂肪酸含量具有一定的调控作用,但能否作为影响高黎贡山猪脂肪酸沉积的主效基因还有待进一步验证。
2021年S1期 v.57 114-119页 [查看摘要][在线阅读][下载 2076K] [下载次数：80 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：25 ] - 赵希桐;潘永杰;张丰霞;刘怡冰;刘华涛;王楚端;
脂肪组织是一个非常复杂的、维持全身能量稳态的组织,脂肪组织的扩增主要包含2个过程:脂肪细胞数量的增多和脂肪细胞体积的增大。脂肪细胞分化过程受多种因子调控。3T3-L1细胞系是目前很广泛的一种研究脂肪细胞分化、脂肪沉积调控的细胞系。课题组在前期研究中发现,ANGPTL4与脂肪沉积有关,并参与PPAR信号通路。为进一步了解ANGPTL4对脂肪细胞分化的影响,本研究在3T3-L1前体脂肪细胞系上干扰ANGPTL4,并观察相关基因的表达量变化。结果发现,ANGPTL4基因和LPL基因有着相反的表达趋势,推测ANGPTL4基因和LPL基因可能组成一个通路,并且ANGPTL4负调控LPL。
2021年S1期 v.57 120-125页 [查看摘要][在线阅读][下载 2608K] [下载次数：124 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：20 ] - 谢磊;秦江涛;李彦朋;黄路生;张志燕;
为探究猪胴体分割产品的占比与大小,以及不同群体的胴体分割产品的差异及其相关性,本研究选择长白、大白及其杂交后代组成的3个不同群体的猪群进行精细分割测定,共计分割测定了1 745头猪的胴体,每个胴体分割为3个分段产品,16个精细分割产品。对所有猪的分割测定数据进行统计分析,确定了不同分割产品的重量及其在胴体中的占比,即出品率;并对不同群体间分割产品的差异进行分析,发现部分分割品的出品率在不同群体之间差异显著。此外,所有精细分割产品的出品率在不同个体之间的变异均较大,且大部分分割产品出品率相关性均较低。本研究首次大规模对长白、大白猪及其杂交后代3个群体的胴体分割产品参数进行估计及比较分析群体间的差异,研究结果为猪胴体组成的育种工作奠定了重要基础。
2021年S1期 v.57 125-131页 [查看摘要][在线阅读][下载 2855K] [下载次数：67 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：20 ] - 吴正明;龚绍荣;赵加鼎;邱丙姗;李再磊;程娜;李文君;李云祥;赵桂英;
本研究旨在探究IGF2基因在保山猪3个组织中的相对表达量对其肉质性能的影响。利用荧光定量PCR技术(RT-qPCR)检测IGF2基因在保山猪背最长肌、背脂、肝脏3个不同组织中的相对表达量,并与保山猪肉质性状进行关联分析。结果表明:IGF2基因在3个组织中的表达量为肝脏>背脂>背最长肌;IGF2基因在保山猪背最长肌中的相对表达量与肌肉化学成分中的粗灰分呈显著负相关,与肌纤维密度呈显著正相关;在背部脂肪中的相对表达量与保山猪熟肉率成显著正相关,与肌肉pH1h和pH24h均呈显著负相关;在肝脏中的相对表达量与保山猪肌肉中的色差a(红度)呈显著负相关。研究表明IGF2基因相对表达量与保山猪肉质性状存在相关关系,但能否作为调控保山猪肉质性能的关键基因还需要进一步深入研究。
2021年S1期 v.57 132-135页 [查看摘要][在线阅读][下载 1765K] [下载次数：58 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：18 ] - 李萌;李娇;张娜;路畅;杨阳;蔡春波;高鹏飞;郭晓红;曹果清;李步高;
环状RNA(Circular RNA, circRNA)是一种具有闭合环状结构的非编码RNA,其在脂肪代谢中具有重要功能。本研究旨在鉴定猪脂肪组织中circIDH2,并对其功能进行分析。通过正反向引物扩增、Sanger测序、RNase R酶消化实验及qRT-PCR鉴定猪脂肪组织中的circIDH2,并研究其表达规律;运用RegRNA、TargetScan、RNAhybrid及Cytoscape软件对circIDH2靶向结合的miRNA以及miRNA调控的靶基因进行预测,构建ceRNA网络图。结果发现,circIDH2在猪脂肪组织中确实存在,其在猪各个组织中均有表达,并且随着日龄的增加,其在脂肪组织中的表达量呈先上升后下降的趋势。另外,本研究构建了与猪脂肪代谢相关的ceRNA网络,其中,circIDH2可与ssc-miR-129a-5p的种子序列结合,ACSL4、EBF1和NFIB也可与sscmiR-129a-5p的种子序列结合,是ssc-miR-129a-5p的靶基因。进一步对ssc-miR-129a-5p及其靶基因的表达分析发现,随着日龄的增加,ssc-miR-129a-5p的表达量呈先下降后上升的趋势,与circIDH2的表达趋势相反。ACSL4与EBF1的表达随着日龄的增加呈先上升后下降的趋势,NFIB的表达随着日龄的增加呈上升趋势。由此推测,circIDH2可能通过海绵化ssc-miR-129a-5p进一步调控ACSL4、EBF1及NFIB的表达来参与猪脂肪代谢调控。本研究结果可为circIDH2在猪脂肪代谢中作用机制的研究提供一定的理论基础。
2021年S1期 v.57 136-142+151页 [查看摘要][在线阅读][下载 3126K] [下载次数：44 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：29 ] - 刘华涛;刘怡冰;石咏;马福平;李航;丁向东;王楚端;
脂肪沉积与生猪生产效率、猪肉品质和繁殖性状密切相关,猪脂肪沉积的调控机制一直是研究热点,且研究多基于脂肪和肌肉组织。本研究以极端背膘厚的长白猪的肝脏组织为研究样本,进行转录组测序,并鉴定长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),之后进行差异mRNA和lncRNA表达分析。通过生物信息学分析筛选出ACAA1、ACLY、APOA4、CRABP1、ELOVL6、FASN、HMGCR、PCK1、SQLE9个可能参与脂肪沉积调控的候选基因。根据lncRNA与mRNA之间的位置关系和表达相关预测它们之间顺式和反式调节方式,并构建两者间的调控网络,发现8个lncRNA参与调控ACAA1、ACLY、CRABP1、ELOVL6、FASN、HMGCR、PCK17个候选基因。该研究结果为脂肪沉积相关的lncRNA的发现和注释提供了新的见解,并为进一步阐明猪脂肪沉积的分子调控机制奠定基础。
2021年S1期 v.57 143-151页 [查看摘要][在线阅读][下载 2477K] [下载次数：148 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：31 ] - 刘怡冰;邢凯;敖红;翟丽维;张丰霞;余健;刘华涛;石咏;马骏;王楚端;
脂肪沉积性状是养猪生产中重要的经济性状,本研究通过对3对具有极端背膘厚度的松辽黑猪全同胞(半同胞)个体的背部皮下脂肪组织进行普通转录组测序,鉴定得到1 029个lncRNA,其中已知lncRNA 343个,新预测的lncRNA 686个。进行差异表达分析后,筛选到37个lncRNA和435个基因在高、低背膘组间差异表达。进一步对差异表达lncRNA进行靶基因预测,共得到54个顺式靶基因,245个反式靶基因,这些靶基因显著富集到多条脂肪合成及代谢相关的通路,包括脂肪酸代谢、不饱和脂肪酸的生物合成等。
2021年S1期 v.57 152-157+163页 [查看摘要][在线阅读][下载 2618K] [下载次数：219 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：27 ] - 吴俊静;阮航;乔木;周佳伟;彭先文;梅书棋;
肌内脂肪含量(IMF)性状是影响猪肉质的重要指标。PLIN2是猪肉质性状的候选基因。本研究在硒都黑猪群体中筛选鉴定了猪PLIN2基因的SNP变异位点。利用混合DNA样本池,采用6对引物PCR扩增了猪PLIN2基因6段不同序列片段,经Sanger测序比对分析后共发现了14个SNP位点。与IMF性状进行关联分析后发现:g1816T>C、g6709G>C、g6808G>A、g6969G>C、g6980C>T、g7032T>C、g7045C>T、g7063G>A、g10027C>T、g10335A>G、g10349C>T等11个SNP位点极显著影响IMF性状。这11个SNP位点可构成4种单倍型,且各单倍型也与IMF性状显著相关。本研究为猪肉质性状的遗传改良提供了新的分子育种标记。
2021年S1期 v.57 158-163页 [查看摘要][在线阅读][下载 1946K] [下载次数：87 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：28 ] - 谭娅;杨琼;甘麦邻;郑婷;雷宇航;黄志洋;沈林園;朱砺;
长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)是一种非编码转录本,其作为重要调控分子参与猪骨骼肌的生长发育已获得广泛关注。目前,通过高通量测序技术,已有数以千计的lncRNAs被鉴定,但其功能调控研究仍待全面解析。本研究基于前期筛选出在青峪猪骨骼肌中高表达的lncRNA G1430,结合生物信息学分析以及与肉质性状、相关基因的相关性结果,提示G1430可能通过MINPP1、GCK、AKR1A1影响糖酵解过程以及能量代谢过程,最终对猪的pH值、肉色亮度(L值)以及滴水损失产生影响。
2021年S1期 v.57 164-170页 [查看摘要][在线阅读][下载 2960K] [下载次数：75 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：19 ] - 赵延辉;邢凯;原佳妮;侍玉梅;马骏;盛熙晖;齐晓龙;倪和民;郭勇;王楚端;
为了选择出更加合适的基因差异表达分析工具,本研究以长白母猪肝脏组织的转录组数据为依据,对EdgeR、Limma、DESeq2 3种基因差异表达分析常用工具进行差异基因筛选能力分析,并结合KEGG通路分析结果对其性能进行综合评价。结果表明EdgeR筛选到差异表达基因数目最多,DESeq2最少,3种工具KEGG通路富集结果相似。最终得出结论为:3种分析工具都有筛选到研究所需目的基因的能力,EdgeR寻找到差异基因数目最多,但假阳性也多;DESeq2对差异基因筛选比较保守,因此筛选到的差异基因数目最少。在后续转录组数据分析中应该根据研究内容及目的等因素选择合适的差异表达基因分析工具。
2021年S1期 v.57 170-173页 [查看摘要][在线阅读][下载 1968K] [下载次数：86 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：29 ] - 廖印长;高虎;张跃博;殷诗舒;徐康;何俊;
本研究屠宰测定了323头宁乡猪背最长肌和头半棘肌pH值(包括pH24h、pH45min值)及肉色性状(包括红度a、黄度b、亮度L),分析了各性状间的相关性。之后利用全基因组关联分析(GWAS)方法对宁乡猪肉质性状相关的候选基因及分子标记进行初步筛选,并通过QQ-plot图对群体层化效应进行了检测。结果表明,相同性状间存在正相关,不同性状间存在负相关,肉色和pH之间存在负相关关系,且均达到强相关水平(|r|>0.18)。群体层化分析没有发现明显的整体系统偏差,也不存在明显群体层化效应。关联分析结果表明共有56个SNP位点达到染色体显著水平,其中12个SNP达到基因组显著水平,分布于猪基因组上的33个区域内(≤1Mb),与pH显著关联的SNP有41个,与肉色显著关联的SNP有15个。根据基因注释和文献检索结果,鉴定出与pH相关的候选基因为IGF2R、GRIK1、PIK3R4基因,与肉色相关的候选基因为FGF10基因和GRM4基因,所筛选出的候选基因主要通过调控肌肉发育和脂肪沉积等途径影响肉色和pH。
2021年S1期 v.57 174-181页 [查看摘要][在线阅读][下载 3055K] [下载次数：233 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：26 ] - 吴旭东;周忍;章会斌;王彩云;郑先瑞;张晓东;殷宗俊;丁月云;
为研究安庆六白猪群体遗传多样性并探索出一种基于SSR标记的安庆六白猪家系划分及亲子鉴定方法。本实验选取14个微卫星位点对98头安庆六白猪的耳组织DNA进行毛细管电泳检测,统计、计算各位点有效等位基因数、杂合度、多态信息含量、遗传距离、排除率等指标。结果显示:14个位点在安庆六白猪群体中共检测出119个等位基因,各位点平均等位基因数为8.5,有效等位基因数处于3.192 7～7.107 8,观测杂合度范围在0.135 8～0.309 7之间,香农指数处于1.326 3～2.131 4之间。S0155等8个位点未达到HardyWeinberg动态平衡,SW240等6个位点达到了Hardy-Weinberg动态平衡。14个微卫星位点累积排除概率达99%。本研究所选取的14个微卫星位点在安庆六白猪群体中均具有多态性,可作为有效的遗传标记应用于家系划分、亲子鉴定等生产实践中。
2021年S1期 v.57 181-186页 [查看摘要][在线阅读][下载 1786K] [下载次数：120 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：19 ] - 田威龙;刘笑笑;程锋;綦文晶;陈奎蓉;李月月;吕冬玲;梁靓;兰干球;梁晶;
在猪的生长发育过程中,肠道菌群的建立及其均衡结构的维持对猪的健康生长具有重要作用,了解仔猪不同生长阶段肠道菌群的结构和功能可为指导其不同阶段的营养调控和饲养管理提供理论基础。本实验采集巴马香猪0 d(初生)、16 d(哺乳期)和40 d(保育期)3个生长阶段的粪便样品,采用16S rRNA基因高通量测序方法,分析巴马香猪不同生长阶段肠道菌群的纵向变化。Alpha多样性指数表明,随着仔猪的生长发育,肠道菌群多样性显著增加,并在保育期多样性达到最高水平;在门水平,作为优势门的厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)在不同生长阶段呈逐渐升高的趋势,而变形菌门(Proteobacteria)呈下降趋势;在属水平,不同生长阶段的优势菌属不同,LEfSe分析发现克雷伯菌属(Klebsiella)、肠杆菌属(Enterobacter)和球链菌属(Globicatella)等好氧菌和兼性厌氧菌为出生0 d(初生)的特异性菌属,随着肠道中氧气的消耗,消化链球菌属(Peptostreptococcus)和消化球菌属(Peptococcus)等专性厌氧菌为16 d(哺乳期)的特征性菌属,饮食的改变使得与消化纤维密切相关的瘤胃球菌属(Ruminococcus)和普氏菌属(Prevotella)成为出生40 d(保育期)时的特异菌属;KEGG功能预测分析发现,随着仔猪的生长发育巴马香猪肠道菌群功能呈动态变化。
2021年S1期 v.57 187-194页 [查看摘要][在线阅读][下载 3436K] [下载次数：211 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：28 ] - 杨雪梅;顾以韧;杨跃奎;梁艳;陶璇;钟志君;曾凯;陈晓晖;龚建军;雷云峰;吕学斌;
本研究采用群体闭锁式核心群选育法,测定川乡黑猪世代种猪生产性能,根据综合指数高低和分子标记辅助选择选留优秀个体;共完成了5个世代的繁殖性能测定,6个世代的生长发育性能测定,旨在研究川乡黑猪的生产性能,为养猪生产提供优秀黑色种猪。结果表明:经过0～5世代选育,川乡黑猪产仔数达10.21头,产活仔数9.59头;达100 kg体重校正日龄公猪、母猪分别为166.99、164.53 d,校正活体背膘厚公猪、母猪分别为10.49、11.36 mm;G5世代肥育性能达100 kg体重日龄、活体校正膘厚、饲料转化率分别为165.93 d、10.63 mm、2.56;G5世代瘦肉率为63.50%,肌内脂肪含量达3.51%,pH值、肉色、嫩度等指标均在正常范围内,肉质性能优良。本研究结果表明,川乡黑猪经世代选育后,生产性能良好,属于优秀的黑色种猪品种。
2021年S1期 v.57 194-199页 [查看摘要][在线阅读][下载 1711K] [下载次数：53 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：17 ] - 沈林園;甘麦邻;郭芝忺;李强;廖坤;朱砺;
非洲猪瘟疫情的爆发使得我国地方猪品种资源受到了前所未有的灭种威胁。本研究旨在评估体细胞克隆技术在地方猪资源保护中的运用效果。通过对4头青峪猪供体细胞的混合胚胎移植研究发现,本次实验代孕地方母猪的妊娠率达100%,重组胚胎发育率最高达3.78%;混合胚胎移植实验表明重组胚胎无明显的个体和母体效应;克隆猪及后代在出生至180日龄阶段的体重和体尺与非克隆猪间无显著差异;克隆公猪的精液品质和克隆母猪的繁殖性能与非克隆猪相比也无显著差异;克隆猪及其后代的端粒长度并无明显缩短现象。本研究为体细胞克隆技术应用于地方猪资源保护提供了可靠的理论支撑和实践指导。
2021年S1期 v.57 200-205页 [查看摘要][在线阅读][下载 2786K] [下载次数：64 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：22 ] - 莫家远;李月月;路玉洁;史良玉;刘笑笑;陈奎蓉;綦文晶;朱思燃;奉玲丽;梁晶;兰干球;
为深入挖掘广西地方猪种的种质特性相关基因,用50K芯片对巴马香猪和隆林猪进行了基因分型,并下载了陆川猪、东山猪、杜洛克、长白猪和大白猪的60K芯片数据,将数据整合后通过多种软件进行群体遗传结构分析、选择信号分析和ROH检测,并对相关位点和区域进行了基因定位与富集分析。结果显示:隆林猪近交程度最低但可能已经受西方商业猪种血液入侵,血统不纯;陆川猪近交程度最高,且与东山猪在遗传距离和亲缘关系上都比较近;去除隆林猪后,共有435个位点受到了选择,以50 kb作为受选择区域共定位到了175个基因,参与了31条信号通路,其中分别有5、9、7、9、1个基因与脂肪、糖尿病或胰岛功能、免疫、繁殖、热应激相关;广西地方猪种共检测到4 491个ROH区域,高频ROH区域主要位于1、4、7、14号染色体,共定位到了48个基因,参与8条信号通路,其中4、3、2个基因分别与免疫、繁殖和肉质相关,4号染色体还存在一个区域被7个品种同时定位,包含的DECR1基因可能与广西地方猪种的独特肉质性状有关。本研究结论为广西地方品种中有DECR1、TNNC1和MTCH2等基因与肉质相关;IL12A、BCL11B和TLR9等基因与免疫功能相关;GNRHR、RBBP4和ALAS1等基因与繁殖性状相关;该结论为广西地方猪种种质资源开发、利用提供了重要理论依据。
2021年S1期 v.57 206-213页 [查看摘要][在线阅读][下载 3195K] [下载次数：169 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：23 ] - 陶璇;梁艳;应三成;钟志君;杨雪梅;雷云峰;龚建军;陈晓晖;舒刚;吕学斌;顾以韧;
试验旨在研究父本新品种"川乡黑猪"作为终端父本的杂交效果。以川乡黑猪和杜洛克猪分别作父本,四川省6个地方猪种、巴克夏×地方猪、川藏黑猪父母代和长×大猪分别为母本,设置12个二元杂交组合和16个三元杂交组合,研究比较各杂交组合商品猪性能。结果表明:以巴克夏×地方猪二元杂交母猪做母本,杜洛克做父本的三元杂交猪(杜洛克×巴克夏×地方猪)的杂毛色比例平均为38.68%,而以川乡黑猪作父本的三元杂交猪(川乡黑猪×巴克夏×地方猪)被毛均为黑色;川乡黑猪与杜洛克分别作父本的二元杂交猪、三元杂交猪的肥育、胴体性能差异不显著,肌内脂肪含量更高(P<0.01),肉质更优。川乡黑猪可替代杜洛克猪作为终端父本,解决优质猪生产中毛色分离问题,同时改善商品猪肉质性能。
2021年S1期 v.57 214-217页 [查看摘要][在线阅读][下载 1679K] [下载次数：53 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：21 ] - 刘倩;岳静伟;牛乃琪;王立贤;张龙超;
为探索椎骨发育相关(Vertebrae Development Associated,VRTN)基因和核受体亚家族6A组成员1(Nuclear Receptor Subfamily 6 Group A Member 1,NR6A1)基因多态性与北京黑猪群体脊椎数的关联性,筛选脊椎数相关的重要分子标记,本研究利用PCR技术和测序技术检测北京黑猪与胸椎数相关的重要候选基因VRTN和NR6A1的单核苷酸多态性(SNPs)位点,开展群体遗传学分析,并与胸椎数和腰椎数进行关联分析。结果显示:VRTN g.20311_20312ins291突变位点在北京黑猪群体中表现为ins/ins、ins/-、-/-3种基因型;g.19034A>C突变位点在北京黑猪群体中表现为AA、AC和CC3种基因型;NR6A1c.748C-T突变位点在北京黑猪群体中仅表现为TT基因型;关联分析结果表明,VRTN g.20311_20312ins291位点与北京黑猪的胸椎数和腰椎数无显著相关;g.19034A>C位点在北京黑猪中野生型个体(AA)的胸椎数显著低于突变纯合个体(CC),突变杂合个体(AC)的胸椎数与野生型个体和突变纯合个体差异均不显著;野生型个体(AA)的腰椎数显著高于突变纯合个体(CC),突变杂合个体(AC)的腰椎数与野生型个体和突变纯合个体的腰椎数差异均不显著。综上,VRTN基因g.19034A>C位点可作为潜在的北京黑猪多胸椎数分子标记。
2021年S1期 v.57 218-221页 [查看摘要][在线阅读][下载 1663K] [下载次数：4 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：15 ] - 崔清明;刘奇;彭英林;陈晨;胡雄贵;朱吉;任慧波;邓缘;刘莹莹;李华丽;左剑波;喻国均;
为了在基因组水平上调查大围子猪群体遗传结构及遗传多样性,本研究利用RAD-seq简化基因组测序技术鉴定480份大围子猪样本中SNP位点的分布,计算近交系数、观测杂合度、两两样本间遗传相关系数,构建系统发育树,进行主成分分析,解析大围子猪的遗传结构及遗传多样性。结果显示:在大围子猪上鉴定出高质量的SNP位点387 935个,1号染色体上SNP数量最多(27 906个),Y染色体上SNP数量最少(1 143个);大围子猪群体中标记杂合度在0.3～0.4之间,且群体平均观测杂合度(0.201 4)低于平均期望杂合度(0.213 0),群体近交系数为0.029 84;大围子猪群体中除少许样本未出现聚类现象外,可以明显分成13个类群,且群体中没有出现显著的群体分离现象。综上所述,大围子猪群体血统纯正,具有丰富的遗传多样性;群体内近交程度较低,且群体内遗传变异高于品种间的变异。本研究为下一步大围子猪的保种和选育提供了一定的参考依据。
2021年S1期 v.57 222-225页 [查看摘要][在线阅读][下载 2401K] [下载次数：122 ] |[网刊下载次数：0 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：16 ]