中国畜牧杂志

2021, v.57(09) 123-128

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牛小黄体细胞与颗粒细胞表达差异基因的筛选及分析

孟金柱;安清明;吴震洋;赵园园;

摘要(Abstract):

本研究旨在通过筛选GEO GSE83524数据集GCs和SLCs中的差异表达基因,进而找出其中参与细胞增殖、分化及生殖激素的分泌相关基因。使用生物信息学相关软件筛选GCs和SLCs中的差异表达基因,并对其进行GO功能富集、KEGG信号通路分析及PPI互作分析;随机选取可能参与细胞增殖、分化及生殖激素分泌的6个基因进行qRT-PCR验证。结果共获得241个差异表达基因,GO功能分析共产生了65个具有显著意义的条目,其中有31组分布在生物学过程,20组分布在细胞组分,14组富集到了分子功能。KEGG信号通路分析,共获得10条通路,其中病毒致癌作用富集最为显著。PPI利用MCC算法筛选出了10个Hub基因。qRT-PCR结果显示,6个基因在SLCs和GCs中的表达趋势与GEO芯片数据一致。这些基因可能参与了SLCs和GCs的增殖、分化、生殖激素的分泌,从而影响从卵泡到黄体的转变。本研究结果为深入研究细胞特异性及细胞分化机制提供了参考。

关键词(KeyWords): 牛;颗粒细胞;小黄体细胞;类固醇激素

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 贵州省科技计划项目(黔科合基础[2020]1Y138);; 铜仁市科技计划项目(铜市科研[2020]80号);; 国家自然科学基金(31702097);; 贵州省重点实验室项目(黔科合平台人才[2020]2003号);; 铜仁市科技局科技支撑计划项目(铜市科研[2020]128号);; 铜仁学院生态畜牧创新团队(CXTD[2020-19])

作者(Author): 孟金柱;安清明;吴震洋;赵园园;

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DOI: 10.19556/j.0258-7033.20201126-01

参考文献(References):

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